1959年，他趁着妻子出差，偷偷把一管液体灌入刚满一岁的儿子嘴里。看着儿子天真的笑容，顾方舟流着泪吻了吻儿子：儿呀，为了亿万孩子的健康，爸爸只能这么做了。爸爸对不起你。
1955年，江苏南通暴发严重脊髓灰质炎疫情。许多孩子在短时间内出现发热、肢体瘫痪，有的终身残疾。
顾方舟参与调查时，亲眼看到病房里一排排打着石膏的孩子。顾方舟后来回忆，那次疫情让自己彻底下定决心，要做疫苗。
1955年至1957年间，顾方舟带领团队从南通、北京、上海等地采集样本，用猴肾细胞培养法分离病毒。三型病毒逐一确认，这是我国首次系统完成脊灰病毒分型工作。分型完成后，疫苗选择才有依据。
1958年，国家决定在云南昆明建设新的疫苗生产基地。顾方舟被派往昆明医学生物学研究所筹建生产线。
那时设备不足，运输不便，实验室建在山地，条件谈不上理想。顾方舟组织技术人员改进培养体系，降低成本，准备引入减毒活疫苗工艺。
1959年初，顾方舟赴苏联考察减毒疫苗生产流程。回国后成立协作组，开始小规模试生产。动物实验显示安全有效，但人体试验必须谨慎。顾方舟和几位同事先自己服用疫苗溶液，连续观察。没有异常反应。
问题在于，成年人多半已有天然抗体，必须选择抗体阴性的儿童。顾方舟知道，这一步绕不过去。顾方舟的儿子顾烈东刚满一岁，血清检测显示没有脊灰抗体。妻子李以莞并不知情。顾方舟选择在妻子出差期间给儿子服用。
喂下疫苗后，顾方舟连续多日观察体温、精神状态，记录血样变化。没有出现异常症状，抗体逐渐升高。
几位科研人员也让自家孩子参与试验，凑齐样本数。风险不是没有，但如果停在动物实验阶段，疫苗永远无法推广。
1960年，第二阶段临床试验扩大至约2000名儿童。发病率明显下降。随后几年，试验规模扩大到数百万儿童。数据不断积累，国家开始准备大规模推广。
推广时又遇到新问题。液体疫苗必须冷藏保存，农村地区缺乏冷链。顾方舟想到将疫苗做成糖丸。团队与药厂合作，把病毒液吸附在奶粉和葡萄糖基质上，反复检测活性。1962年第一批糖丸疫苗问世。
到1990年，全国启动消灭脊灰规划。顾方舟已步入晚年，仍担任技术顾问。加强急性弛缓性麻痹监测，防止野病毒传播。1994年后未再发现本土野病毒病例。2000年，世界卫生组织宣布中国实现无脊灰状态。
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